镇江检验检疫局是江苏检验检疫局的分支机构，实行垂直领导的管理体制，依据《中华人民共和国进出口商品检验法》《中华人民共和国进出境动植物检疫法》《中华人民共和国国境卫生检疫法》《中华人民共和国食品安全法》以及相关条例对镇江地区的进出口商品所涉及的安全、卫生、环保和反欺诈等方面进行检验鉴定和监督管理，对出入境人员交通工具、集装箱等进行卫生检疫、传染病监测和卫生监督，对进出境动植物进行检疫，以保护人民群众的身体健康和安全，保护动植物的健康和安全，保护环境，防止欺诈行为，维护国家安全。

　　在镇江港、丹阳和镇江新区设立三个副处级办事处机构，在句容、扬中设立报检签证点，镇江地区检验检疫业务实现了产地——口岸——陆路的多点延伸。