紧接着，邓小平把整顿的重点移向铁路。当时，全国正在搞批林批孔运动，大多铁路部门都在进行政治运动，运动中又引发了派性，出现了极大混乱，派性斗争十分激烈。徐州、南京、南昌等铁路局发生了运输堵塞现象，严重阻碍了津浦、京广、陇海、浙赣四条大干线，积压的货物堆积如山，旅客列车经常晚点。铁路的混乱直接危及工业生产和城市人民生活，也使许多城市发生了混乱。邓小平决心抓住铁路这个影响大局的全国经济薄弱环节进行整顿。为此邓小平经请示毛泽东同意，于1975年2月25日至3月8日在北京召开了全国工业书记会议，专门研究解决整顿铁路问题。

　　在全国工业书记会议基础上，中央于3月5日做出《关于加强铁路工作的决定》，经毛泽东同意后，作为中央9号文件下发。这个决定的主要内容是：改进铁路管理体制；建立健全必要的规章制度；加强组织纪律性，确保运输安全正点，同各种破坏行为作斗争。会后，铁道部部长万里率领工作组，先后去徐州、太原、郑州、长沙等地，贯彻中央9号文件，对问题严重的路局进行了重点整顿。经过两个多月的整顿，打乱了派系组织，撤职、调动了各路局中的派性头头，恢复了必要的规章制度，建立了生产秩序。到4月份，过去严重堵塞的铁路全部疏通，全国20个路局有19个超额完成了国家的计划，全国铁路平均日装车数创造了历史最高水平，列车正点率大为提高。铁路的整顿带动了全国工业生产的好转。1至4月份，全国工业总产值比1974年同期增长19.4%。

　　邓小平领导整顿，实质就是部分地纠正“文化大革命”的错误，而整顿中坚决反对派性，打击和严肃处理派性头头，实质上就是打击“四人帮”在下面的爪牙，这自然会引起“四人帮”的仇恨，他们也必然要对邓小平领导的整顿进行捣乱和破坏，对邓小平进行“反击”。就在邓小平大刀阔斧地进行整顿时，江青等人指使他们手下的爪牙对抗整顿，不听调动，反而贴出大字报等进行反扑，把矛头直接对向了工作组，甚至指向了万里，声称要继续同“走资派作斗争”。但是，邓小平鼓励万里，不听那一套，对不服从调动的就不发工资，直到进行法办。造反派们经不住不发工资和反复调动，七调八调，“四人帮”手下的爪牙就作鸟兽散了。